Серьёзным минусов Windows 8 был дефицит приложений для данной платформы. Кроме того, некоторые весьма популярные приложения и вовсе отсутствуют а, программы от сторонних разработчиков выходят с задержкой.

Однако, похоже на то, что с релизом Windows 8.1 Microsoft смогла решить эту проблему. Например, в данный момент в магазине доступно более 125 тысяч приложений, львиная доля которых бесплатна. Согласно статистике MetroStore Scanner, который подсчитывает количество приложений, после выхода Windows 8.1 в онлайн-магазин каждый день появляется сотни новых предложений.

Серьёзной проблемой Windows Store является большое количества спама. Многие приложения, доступные для скачивания в онлайн-магазине, являются поддельными и пытаются похитить деньги пользователя.